Maanviljelijän poikana Reisjärven Pekkaperällä syntynyt Viljami Niinikoski oli jo nuorena kiinnostunut metsäalasta. Hän teki talon töiden ohella metsä- ja uittotöitä. Hän eteni työnjohtajaksi tehden töitä eri yhtiöissä, kunnes hakeutui Hirvaan metsäkouluun Rovaniemelle ja sai sieltä metsäteknikon todistuksen 1926. Tutkinnon jälkeen ensimmäinen työpaikka oli Himango & Ylivieska Oy:ssä, josta hän siirtyi Haapajärven sahan palvelukseen.
Pääosan elämäntyöstään Viljami Niinikoski suoritti yksityismetsätalouden eri tehtävissä. Vuosina 1927–1928 hän oli Oulun läänin talousseurassa metsänhoidon neuvojana ja Keski-Pohjanmaan metsänhoitolautakunnan metsätalousneuvojana 1929–1943. Tämän jälkeen hän oli lyhyehkön ajan Oulu Oy:n piirityönjohtajana ja piiriesimiehenä Haapajärven piirikonttorissa.
Puutavaratoimisto Hellgrenin puutavaran hankintamiehenä hän toimi vuodesta 1947 ja harjoitti myös omaa puutavara- ja henkilövuokra-autoliikettä. Myös yhteiskunnalliset asiat kiinnostivat Viljami Niinikoskea.
Kun Kyösti Kallio oli ehdokkaana tasavallan presidentiksi 1937, valittiin Viljami Niinikoski hänen valitsijamiehekseen Oulun läänin eteläisestä vaalipiiristä. Hän sai 1 177 ääntä, joka oli neljänneksi paras seitsemän valitsijamiehen joukossa. Niinikoski toimi presidentin valitsijamiehenä vielä kaksi kertaa sota-aikana. Valitsijamiesvaalia oli edeltänyt vuosia kestänyt aktiivinen toiminta maalaisliitossa. Niinikoski tunnettiin puolueväen piirissä selväsanaisena ja selkeästi kantansa ilmaisevana miehenä.
Paikallistasolla Niinikoski toimi muun muassa Haapajärven kirkonkylän kansakoulun johtokunnassa, Haapajärven osuuskassan hallintoneuvostossa sekä lukuisten muiden yhdistysten johtokunnissa tai yhdistyksen aktiivisena jäsenenä. Innokkaana erämiehenä hän on ollut perustamassa Haapajärvelle riistanhoitoyhdistystä ja metsästysseuraa. Niinikoski toimi myös pitkään vanhoillislestadiolaisen herätysliikkeen maallikkopuhujana.
Vapaussodan aikana 1918 Niinikoski toimi vartio- ym. tehtävissä ja talvisodan aikana 1939–1940 polttoainehankinnoissa. Hänen elämänsä päätti 51-vuotiaana jo nuorena ilmennyt vakava sydänsairaus.